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赵东宇医学信息 ,研究员,博导

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主要学习及工作经历 2001.9-2005.7 吉林大学计算机科学与技术专业 本科生 2006.9-2009.7 吉林大学计算机应用技术专业 硕士研究生 2015.4-2015.10 美国内布拉斯加林肯大学 博士后 2015.4-2020.10 美国休斯敦Methodist研究所 博士后 2020.10-2021.1 美国波士顿儿童医院 博士后 2009.7-2010.9 中国科学院北京基因组研究所 研究实习员 2010.9-2013.7 中国科学院北京基因组研究所 博士研究生 2013.7-2015.4 中国科学院生物物理研究所 助理研究员 2021.4-至今 北京大学基础医学院 研究员,博导
主要学术任职 Frontiers in Genetics期刊 学术编委
获奖情况 美国Moran Foundation Award
研究方向 1)疾病中细胞识别调控的遗传和表观遗传机制的计算模型研究,尤其是肿瘤的发生; 2)开发新的生物信息学技术,并利用这些技术来了解系统级的调控机制; 3)与实验生物学家合作,利用生物信息学获得对各种癌症、发育、干细胞的前沿生物学见解。
基金来源 北京大学基础医学院引进人才计划与启动基金
代表论文 1. Dongyu Zhao#, Lili Zhang#, Min Zhang, Bo Xia, Jie Lv, Xinlei Gao, Guangyu Wang, Qingshu Meng, Yang Yi, Sen Zhu, Alin S. Tomoiaga, John P. Cooke, Qi Cao, Kaifu Chen. Broad Genic Repression Domains Signify Enhanced 1 Silencing of Oncogenes. Nature Communications. 11, 5560(2020). https://doi.org/10.1038/s41467-020-18913-8. 2. Shilpa S. Dhar#, Dongyu Zhao#, Tao Lin, Bingnan Gu, Khusboo Pal, Hunain Alam, Jie Lv, Vidya Gopalakrishnan, Wei Li, Ali Shilatifard, Roy V. Sillitoe, Kaifu Chen^, Min Gyu Lee^. MLL4 Is Required to Maintain Broad H3K4me3 Peaks and Super-Enhancers at Tumor Suppressor Genes. Molecular Cell. 2018. 70, 825-841. 3. Bo Xia#, Dongyu Zhao#, Guangyu Wang#, Jie Lv, Alin S. Tomoiaga, Min Zhang, Yanqiang Li, Xin Wang, Shu Meng, John Cooke, Qi Cao, Lili Zhang, Kaifu Chen. Machine Learning uncovers cell identity regulator by histone code. Nature Communications. 2020. 11, 2696. 4. Sen Zhu#, Dongyu Zhao#, Lin Yan#, Weihua Jiang, Jung-Sun Kim, Bingnan Gu, Qipeng Liu, Rui Wang, Bo Xia, Jonathan C Zhao, Gang Song, Wenyi Mi, Rong-Fu Wang, Xiaobing Shi, Hung-Ming Lam, Xuesen Dong, Jindan Yu, Kaifu Chen, Qi Cao. BMI1 regulates androgen receptor in prostate cancer independently of the polycomb repressive complex 1. Nature Communications. 2018. 9, 500. 5. Sen Zhu#, Dongyu Zhao#, Chao Li#, Qiaqia Li, Weihua Jiang, Qipeng Liu, Rui Wang, Ladan Fazli, Yinan Li, Lili Zhang, Yang Yi, Qingshu Meng, Wanyi Wang, Xiongbing Zu, Wei Zhao, Tuo Deng, Jindan Yu, Xuesen Dong, Kaifu Chen, Qi Cao. BMI1 is directly regulated by androgen receptor to promote castration resistance in prostate cancer. Oncogene. 2020. 39, 17-29. 6. Yongbing Zhao#, Chen Sun#, Dongyu Zhao#, Yadong Zhang, Yang You, Xinmiao Jia, Junhui Yang, Lingping Wang, Jinyue Wang, Haohuan Fu, Yu Kang, Fei Chen, Jun Yu, Jiayan Wu and Jingfa Xiao: PGAP-X: Extension on pan-genome analysis pipeline. BMC Genomics. 2018. 19, 36. 7. Dongyu Zhao#, Jiayan Wu#, Yuanyuan Zhou, Wei Gong, Jingfa Xiao, and Jun Yu. WikiCell: A Unified Resource Platform for Human Transcriptomics Research. OMICS: A Journal of Integrative Biology. 2012. 16, 357-362. 8. Dongyu Zhao, Yan Wang, Di Luo, Xiaohu Shi, Liupu Wang, Dong Xu, Chunguang Zhou, Jun Yu, Yanchun Liang. PMirP: A pre-microRNA prediction method based on structure-sequence hybrid features. Artificial Intelligence in Medicine. 2010. 49, 127-132. 9. 赵东宇,王岩,罗迪,周春光,梁艳春。生物信息学中的microRNA预测研究。吉林大学学报。2008。26(3),276-280。

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